2015年6月27日
生物分子晶体生长的母液将包含水、缓冲分子,本机配体和辅助因子,结晶沉淀剂和添加剂,各种金属离子和小分子配体或抑制剂。大约一半的体积平均生物分子晶体由母液,形成无序大部分溶剂的组件。
鉴于良好的动力学,大分子自组装可以从亚稳态,过饱和溶液成晶体,周期性的大分子网络连接弱,但特定的分子间的相互作用。来源:Weichenberger et al。
溶剂是积分,因此,也常常几乎任何大分子晶体结构的内在组成部分。其无序大部分组件以及命令不同性质的成分需要占在造型和精致。提高散装溶剂从基本角度描述主要是由方法的发展。在散装溶剂提纯,用户选择超越有限solvent-model选择,因此没有多少机会引入偏见或特定模型错误,但需要说明的是,次优掩蔽有时可以引入密度文物。相比之下,造型独特的溶剂电子密度几乎总是需要深思熟虑的解释,并使用适当的工具(自动化)构建和验证可以大大提高结构的质量模型。
在论文[Weichenberger et al。(2015)。Acta结晶。D71, 1023 - 1038;doi: 10.1107 / S1399004715006045]一群作者研究如何估计大分子晶体的整体溶剂内容,如何解释和模型无序大部分溶剂以及如何正确识别和模型不同的电子(或核,在中子衍射的情况下)的密度要求溶剂分子。作者还强调造型生物学上重要的蛋白质分子与溶剂之间的界面区域仍然是不完整的,和高级溶剂模型的动态区域需要开发。
来源:http://www.iucr.org