瑞士蛋白质组学公司Biognosys AG今天宣布了其第二份版本Spectronaut™用于分析超反应监测(HRM)数据的软件。
HRM是一种有针对性的蛋白质组学技术,可以在单个仪器运行中对1000蛋白进行可重现和准确的量化。因此,它弥合了shot弹枪蛋白质组学规模之间的差距,能够鉴定许多蛋白质和MRM/SRM的定量精度,从而可以高质量地量化较少数量的蛋白质。
HRM基于对新一代质谱系统进行的独立数据采集(DIA)。直接在Thermo Scientific™Q Extrive™混合动力四极轨道质谱仪允许从样品中存在的所有检测到的前体离子中获取MS/MS信号,类似于在AB SciexTripletof®5600+系统上执行的Swath™Aquisisition。HRM将DIA与高分辨率MS/MS,大光谱库以及用于数据反卷积和分析的目标方法相结合。
Spectronaut™软件首先是由Biognosys于2013年1月推出的,用于分析Swath数据。新软件版本还支持对Q Quartive生成的DIA数据的分析。与此版本一起,Biogognosys为Q Exptive提供了一种采集方法,该方法已针对高含量量化实验进行了优化。
此Spectronaut™版本的其他新功能包括高级HRM特定的峰值评分和新的可视化选项,例如多运行对齐视图。Spectronaut™使用专有的高速数据格式,该格式允许在几分钟内处理100000次过渡。此外,Spectronaut™合并了用于HRM的高级Mprophet算法(自然方法,2011年),以实现准确的信号检测和统计有效的峰值评分。Spectronaut™背后的强大原理是软件算法与试剂套件的集成 -HRM校准套件- 在特定的色谱和质谱仪设置上,为任何最终用户系统提供了最佳的自定义参数校准。Spectronaut™是一个用户友好的桌面应用程序,可以在标准笔记本上安装并运行。
Biognosys目前提供HRM技术作为发现应用程序和高度多重蛋白质定量的服务。借助第二Spectronaut™,对于学术研究人员,Biognosys是免费的,将其客户群扩展到了Q的用户,从而促进了进一步采用人力资源管理技术,并支持应用和学术研究之间的开放创新和协作。