质谱(MS)基于蛋白质组学已成为一个强大的技术,使研究人员能够深入挖掘和更快的投入到蛋白质组。它可用于确定和数千种蛋白质的定量;但是,完整的蛋白质组的覆盖面仍然有限,因为当前质谱仪的速度,灵敏度和分辨率。
所述timsTOF Pro使用并行串行积累碎片(黑豹)获取方法与鸟枪蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学达到新的深度,使用低样品量的能力极大地传送高速和灵敏度。
双TIMS技术达到高灵敏度和高速鸟枪蛋白质组学接近100%的占空比。创新的设计允许在前面部分中积累的离子,而在后段的离子被顺序取决于它们的离子迁移率释放。
该timsTOF Pro是由黑豹,这被看作是完美的适合猎枪蛋白质组学供电。它提供了超过100赫兹测序速度更高,而不会失去灵敏度和分辨率。这是通过用来自TIMS漏斗特定的肽包的洗脱时间同步的四极型质量隔离窗口来完成。
离子光学器件的新的正交设计赋予它优越的鲁棒性。稳健的其前无法实现的水平已经被淘汰,猎枪蛋白质组学性能现在凋零在大样本队列,按要求在临床研究蛋白质组学。
MaxQuant /修斯和PEAKS Studio中启用数据处理现在允许挖掘成4-TH.尺寸。开放式的文件数据格式手段,研究人员可以用原始数据,并使用行业领先的软件直接工作。MaxQuant已被修改在通过保留时间,离子迁移率,质量和信号强度跨越的空间来管理4维特征。
这有利于肽类,蛋白质和翻译后修饰的识别和量化。PEAKS工作室联合收割机德诺维与传统的数据库检索测序和被增强以处理timsTOF原始数据。
我们现在知道肽混合物在两个维度上分析它们时(保留时间和m / z)仍然极其复杂。
增加一个维度应该原则上很长途领先。除了分离的额外尺寸外,TIMSTOF PRO提供了极高的速度和敏感性,以使用更少的样品材料更深地进入蛋白质组。
马蒂亚斯·曼教授,博士,蛋白质组学处处长和信号转导,生物化学,德国马克斯 - 普朗克研究所
timsTOF临 - 用于猎枪蛋白质组学新标准