Bruker的TopSpin™软件包,用于NMR数据分析

Bruker的TopSpin™软件包专为NMR数据分析和NMR谱的采集和处理而设计。该软件包TS3.5PL6是Bruker的最新版本,并提供了一种新的易于使用的GUI,可轻松访问庞大的实验图书馆,包括典型的Bruker脉冲序列,以及学术和工业用户的用户生成的实验图书馆。

GUI使用户能够通过简单的拖放构建和组织自己的定制实验库,启用基于脚本的参数修改,提供了许多用于实验设置和优化的选项,并使高级实验设置简单有效。

TopSpin提供了一个完整的工作流程为导向的用户界面,并利用现代Windows / MacOS / CentOS操作系统的现代64位功能,以实现最佳内存使用情况。其新的工作流程为导向和直观的用户界面和优化的示例数据管理都提供了一长串额外的创新功能列表,意味着完全加速操作和采样分析吞吐量以获得更好的成本效率。如果需要在学生版本中提供TopSpin,以帮助教育和学术界的机构来改善学生的课程。

TopSpin是通过高度直观的界面构建,应用了文字处理,演示程序或图形熟悉的最广泛的标准,在Windows上为NMR应用程序提供相同的外观®,mac和linux®

特征

TopSpin™软件包的关键功能如下:

  • 航空和傅立叶光谱仪的总控制
  • 用于处理,显示和分析多维和单谱的综合功能
  • 直观的行业标准用户界面,常规用户和专家的理想解决方案
  • 无限的离线处理能力
  • 辅助收购
  • 先进的非均匀采样技术
  • 小分子表征
  • Biotoolstm - 生物分子NMR制造简单
  • 方法开发环境
  • 用CMC-SetM的微小分子阐明简单有效的结构
  • 固态NMR的线厚分析,包括动态NMR
  • 结果发布,预定义和用户定义的布局
  • 法规遵从性支持工具(审计追踪,自动归档,电子签名)
  • 大学和学生的特殊许可证

技术细节

用户界面

  • 完整的处理,显示和分析多维和单谱的功能
  • 直观的行业标准用户界面,标准用户和专家的理想解决方案
  • 辅助收购
  • Deconvolution / Spectrum仿真/迭代
  • 结果发布,预定义和用户定义的布局
  • 个人用户自定义(实验,工具栏,命令,工作流程)
  • 完整的文件
  • 法规遵从性(GMP,GLP)支持工具(电子签名,审计尾随,自动归档)
  • PC (Linux / Windows)或Mac
  • 灵活的各种应用许可
  • 高校学生的特殊许可证

支持的操作系统

支持顶部3.5在光谱仪计算机上得到支持:

  • Windows 7(64位)
  • CentOS 7.1(64位)
  • CentOS 5(64位)

支持数据站的TopSpin 3.5:

  • Windows Vista(32位)
  • Windows 8.1(32-和64位)
  • Windows 7(32-和64位)
  • CentOS 7.1(64位)
  • CentOS 5(32-和64位)
  • mac-os x 10.8或更新

为了有效地安装和操作CentOS下的TopSpin,将需要额外的软件包:

  • CentOS 7的TopSpin安装要求
  • CentOS 5的TopSpin安装要求

收购和处理包

  • Biotools™ - 蛋白质NMR变得简单
  • 固体线海拔分析
  • 非统一采样(选项)
  • 小分子结构阐明(选项)
  • 结构化学换档预测(选项)
  • 结构置信度分析(选项)

应用程序

绝对量化 - CMC-Q

可以自动地执行一系列样品的绝对量化,从而使用户能够定义质量含量,纯度和相对量的物质。这为药物发现筛选应用提供了完全自动浓度的测定。

结构阐明CMC-SE

从化学式和标准NMR实验开始,自动选择峰值并进入相关表中。然后使用结构确定算法和产生与数据一致的结构来解释该数据。然后,这些结构可以与化学换档预测相比进行排序,从而缩小可能性,以帮助研究人员建立其结构。

非统一抽样

TopSpin 3.0目前具有非统一采样(NUS),这是一个完全集成的采集和处理功能。它允许重复使用,可用于各种NMR实验。自动生成和优化的NUS稀疏列表建立了采样模式,从而产生了分数数据采集。然后,多维分解然后允许计算缺失的数据点,从而实现完整数据集的常规傅立叶变换处理,全部以完全自动的方式执行。

NUS消除了高分辨率多维NMR光谱的时间屏障,并且对生物分子NMR中的多维实验特别有益,其中在3D实验中的时间节省4倍,甚至更多的4D和5D实验中可以节省意识到。新的蛋白质结构测定实验现在可行。

基于2D光谱的小分子应用还可以从更快的采集增加一倍数。这里的键突出显示在不必增加整体采集时间的情况下进行频谱分辨率和质量的改进。

新加坡国立大学在TopSpin的实施结果来自与Orekhov教授及其同事的研究伙伴关系。NUS in TopSpin 3.0得益于成熟的算法和程序,如NUS sampler和MDDNMR (Orekhov, V.Y., I. Ibraghimov, and M. Billeter, J. Biomol.)。核磁共振,2003年。27 (2): p。165 - 173年)

动力学中心

新的动态中心是一种以技术为导向的工作流程,利用高效的蛋白质数据评估,提供所有适用的动态参数,例如REX,T1,T2,具有最小用户交互。新功能主要用于探索大生物分子的动态。

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