未染色组织中细胞类型的分类图像

的Spero®利用基于激光的红外显微镜来产生高清晰度,使用标准化组织学方案制备的未染色薄结肠组织切片的化学图像。接下来,使用常规化学计量分析技术与数据一起使用,从而可以识别和分段组织类型。

解决方案

薄(10μm)的光谱图像数据立方体在用第一代获得之前安装在红外玻璃载玻片上。Spero®显微镜.它的光谱范围为900 - 1800厘米−1(5,500 - 1,100 nm),像素分辨率为1.3 μm,衍射分辨率为0.7 NA,单片视场(FOV)为650 μm × 650 μm。

录音由覆盖全波段(900 - 1800厘米)的图像立方体制成-1在4厘米-1步骤),以及以波段内10个稀疏选择频率为目标的立方体。然后在ImageLab中进行分析®来自奥地利维也纳的Epina软件公司的多模态化学计量学软件。

为了帮助化学计量学数据简化,对原始图像立方体进行了以下顺序的预处理:

  • 使用众所周知的最大噪声分数变换进行降噪
  • 对具有酰胺I峰值(1656厘米)的像素的排斥-1),测量值小于0.05 AU(作为光谱质量测试)
  • 全带光谱转换成第二衍生物以去除基线
  • 使用Savitzky-Golay算法9分平滑
  • 对所有谱向量进行谱归一化,以达到零均值和单位标准差。这样做是为了减少细胞密度和组织厚度差异引起的强度变化的影响。

完成预处理步骤后,满带(900-1,800厘米-1)通过无监督的K均值聚类方法分析第二衍生数据集。这是一个非分层迭代方法,可为每个频谱获得“硬”类成员资格。

接下来构建6个类的假彩色图像,每个像素在总成像字段中分配了具有相应颜色的类成员资格。基于该特定像素的频谱响应,使用这种虚假着色方法意味着观察者具有快速,简单的“看到样品中的生物化学差异的方式。在这种情况下,关键差异对应于细胞和组织结构的基本类型。

结果

从k-means聚类图像中可以清楚地看到结肠组织的不同结构。这包括结肠隐窝、粘膜下层和固有层。特别是在结肠隐窝内,光谱特征包括1044、1076、1120和1374 cm处粘蛋白糖基化条带的组合-1与1,740厘米处的透明脂质酯带一起-1

然而,相反,粘膜下粘膜可通过多种强带鉴定,该强带可以与1,204,1,236,1,280,1,336(酰胺III)和1,452cm(酰胺III)和1,452cm(1,336厘米)直接连接到具有带的结构蛋白胶原蛋白-1分别。

固有层和腺癌之间的光谱差异是非常微妙的。它们位于约964、1062、1090和1236厘米的与核酸相关的振动处-1

可以看到,10频稀疏图像立方体数据集用于创建胶原蛋白、蛋白质和粘蛋白丰富区域的高速定性化学图,然后可以用来指导更详细的探索和分析。

该信息来源于Daylight Solutions Inc.提供的材料,并经过审查和改编。亚博网站下载

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引用

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    Daylight Solutions Inc ..(2020年3月17日)。在未染色的组织中分类细胞类型的图像。Azom。从Https://www.washintong.com/article.aspx?articled=16755从//www.washintong.com/article检索。

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    Daylight Solutions Inc ..“在未染色的组织中分类细胞类型的图像”。氮杂.7月20日2021。

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    Daylight Solutions Inc ..“在未染色的组织中分类细胞类型的图像”。Azom。//www.washintong.com/article.aspx?articled=16755。(访问于7月4日,2021年7月)。

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    Daylight Solutions Inc .. 2020。未染色组织中细胞类型的分类图像.《AZoM》,2021年7月4日观看,//www.washintong.com/article.aspx?ArticleID=16755。

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